动物资源：南阳市目前共有鸟类271种，隶属于17目，44科，133属，约占全省鸟类总数的71％。列入国家级保护的鸟类49种，占全省总数的67.9％。其中国家一类保护鸟类8种，包括黑鹳、金雕、白肩雕、白尾海雕等；国家二类保护鸟类41种，包括斑嘴鹈鹕、松雀鹰、苍鹰等；全省共有23种省级重点保护的鸟类，南阳市占20种。

　　兽类资源有62种，隶属于6目，19科，47属，占河南省总数的86.1％，其中东洋界型25种，占40.3％；古北界型21种，占33.9％；广布型16种，占25.8％，东洋界种略占优势，全省有12种国家级保护兽类，其中11种在南阳有分布，属国家一类保护的金钱豹，华南虎也有记录，但现已灭绝。国家二类保护的兽类包括水獭、大灵猫、金猫、豺等10种，属省级重点保护的9种兽类在南阳均有分布。

　　两栖类45种，隶属2目，4科，6属，占河南省总数的73.7％，其中广布型5种，古北界2种，东洋界7种，东洋界成分占优势，两栖类中的大鲵，俗称娃娃鱼，是国家二级保护动物；虎纹蛙，既是省级重点保护动物，又是重要的经济动物。

　　爬行类31种，隶属于3目，8科，18属，占河南省总数的83.8％。其中广布型8种，古北界5种，东洋界18种，东洋界成分占优势。爬行类中的活蛇是南阳的一大特产，但由于大量捕捉、贩卖，资源逐年下降。

　　鱼类67种，隶属于5目，11科，47属，占河南省总数的60.9％，其中以鲤形目最多，有57种，占85％；鲈形目7种，占10.5％。本区大多数鱼类具备较高经济价值和较大产量，是主要的养殖和捕捞对象。

　　昆虫区系约3000余种，经鉴定和整理的主要昆虫有939种，隶属于15目，157科，主要集中于半翅目、鳞翅目等7目，达914种，占已知昆虫总数的97％，其中仅蝶类就有108种，占河南省总数的80％以上。

　　植物资源：南阳市地处北亚热带向暖温带过渡地带，全市共有维管束植物184科927属2298种，其中蕨类植物26科62属179种，裸子植物8科15属24种，被子植物150科850属2092种。该区植被类型以阔叶林和针叶林为主。阔叶林是本区森林群落的主体，分布面积广泛，是本区的主要用材林、水源涵养林和经济林，主要树种有山茱萸、锐齿栎等。针叶林有28种，主要树种有华山松、马尾松、油松、铁杉等。在南阳市自然保护区中生存的116种珍稀植物中，列入国家一级保护植物的有银杏、红豆杉、南方红豆杉等4种；列入国家二级保护植物的有大果青杄、连香树、香果树等13种。河南省重点保护的47种植物在南阳市均有分布，另外还有52种植物为南阳市珍稀特有植物。